Life Technologies大中华区新一代测序数据解决方案中心宣布在京成立
2010-11-16 16:48
2010年11月2日,美国Life Technologies所属爱普拜斯应用生物系统贸易(上海)公司,宣布在北京设立其大中华区新一代测序数据解决方案中心。借助生物信息技术的深化应用,该中心旨在帮助使用SOLiDTM基因测序系统的客户进行系统运行之后建立数据分析方案,从而更加有效地利用研究数据结果。SOLiD是Life Technologies创新研发的一套基于连接法原理的高通量基因测序仪 。这套设备以其无以匹敌的高精准度、可扩展的平台、自动化的工作流程、便于应用的工具包、整体性的数据分析方案以及多方位的后台支持为科学家们提供了一个功能强大的平台。世界各国的研究人员使用SOLiD对癌症、糖尿病、神经障碍等疑难病症患者的基因特性进行研究并以此推进个性化医疗的发展和普及。应用测序科技以及数据分析去了解患者的基因特点,可以加速医疗工作者实现针对个体病患的基因组成来制定相应的个性化诊疗方案的目标。同时,该技术的应用还可以提高人类对癌症的预知和预防能力,防患于未然。研究人员使用SOLiD新一代测序系统进行基因测序积累了大量的数据,亟需进行更深入与系统的分析以获取理想的分析结果。该中心的成立将进一步强化SOLiD原有的数据分析能力。 该中心的建立是Life Technologies以客户为中心这一理念的具体体现。 Life Technologies亚太区总裁司马德利先生说, 我们希望该中心不仅能够帮助客户跨越在数据分析方面的瓶颈,更重要的是能增进我们与客户的密切合作,联手推进基因测序、基因分析和个性化医疗等领域的发展,从而为攻克像癌症这些对人类生命构成重大威胁的疾病做出我们的贡献。 如今在中国,无论在作物育种还是药品研发领域,都有越来越多的科研人员在应用基因测序技术进行研究。 Life Technologies 大中华地区总裁何国威先生说。 新建成的中心提供的数据分析服务将在客户的研究实验中起到非常重要的作用。 研发能力是这个中心不可分割的一部分。该中心的科学家正在紧锣密鼓地就前沿性的生物信息学课题进行研究,例如全新基因组混合拼接法数据分析流程,该技术能够帮助SOLiD客户组合之前未知的基因。中心将借助Life Technologies全球研发中心的力量,竭尽全力为亚太地区的SOLiD用户提供世界一流的生物信息学方面的支持、培训与解决方案。在试运营阶段,该中心将指导客户进行SOLiD首次运行数据分析,并系统化地为客户提供数据分析培训,为硬件设备与人员配备提供咨询和建议。从2011年起,数据分析中心将进一步强化数据分析培训服务,并在合作项目中为客户提供更强大的支持。该中心在起始阶段专注于服务大中华区的客户,未来会将服务延伸到整个亚太地区。关于Life Technologies:Life Technologies(纳斯达克证劵交易所代码:LIFE)是一家致力于改善人类生存状况的全球性生物科技设备公司。公司的系统、消费品以及服务使得研究人员能够更高效地从事科研活动,通过推动科学进步与创新为人类创造更美好的生活。Life Technologies的客户横跨了与生物学相关的各个领域,分布于个性化医疗、再生科学、
分子诊断、农业与环境科学研究以及21世纪法医学等行业及学科。2009年,公司的年销售额达到33亿美元,拥有近9000名员工,在160个国家开展业务;Life Technologies在知识产权方面拥有近3900项专利以及独占性许可证。该公司由英杰公司(Invitrogen Corporation)和爱普拜斯应用生物系统公司(Applied Biosystems Inc.)合并而成,生产试剂、体外诊断以及实验室研究专用仪器设备等产品。更多Life Technologies信息,敬请访问::http://www.lifetechnologies.com
有关基因分析及个性化医疗背景资料
基因测序与个性化医疗
基因测序将为医学领域带来难以估量的价值。首先,在医学领域中,根据每个人DNA的序列差异化的存在,个性化医疗方案将逐步替代千人用一药的传统医学治疗方案。基因序列的获取将为人类的遗传疾病以及癌症等疾病的致病机理提供有利依据,并为接下来的分子诊断、基因治疗等个性化医疗提供必要前提条件,最终帮助人们达到有的放矢进行疾病的预防和治疗的目的。更重要的是,通过基因治疗,不但可预防当事人日后发生疾病,还可预防其后代发生同样的疾病。其次,当基因测序逐步普遍时,医生就能真正根据病人自己基因提供的信息,来提供 个性化治疗 。
以SOLiD为代表的高通量基因测序系统使用连接法测序,以获得基于 双碱基编码原理 的颜色编码序列,之后对原始颜色序列以及转化后的颜色编码序列的差异进行数据分析。研究者及临床工作者可以根据这一分析结果制定相应的解决方案。另外,建基于生物信息学基础的数据分析方法又再次保证了研究者可以得到更加准确而有效的信息,使测序设备的功用发挥到最大。
基因测序系统如今在国内已经为一些医疗研究机构所应用,这为我国的肿瘤学研究及临床上对癌症的预防与治疗提供了更强大的技术支持。另外,随着这一技术的不断发展和精进,单个患者的测序成本在逐渐降低。医疗领域实现最终的个性化、差异化离我们已不再遥远。点此详见Life Technologies与相关机构的合作显示了测序技术应用在治疗癌症方面的进展。
Science Translational Medicine的一篇论文刊登了约翰霍普金斯大学凯莫癌症研究中心和Life Technologies的一项研究成果,该研究证明新一代测序技术可以检测出乳腺癌及直肠癌等固态肿瘤病例中染色体的变异情况,对具有特异性的生物大分子的识别有可能会在研究人员日后在研发控制病情发展和肿瘤对治疗反应的诊疗产品时,提供有效的帮助。
Wellcome Trust Sanger Institute和爱普拜斯应用生物系统公司在Nature上联名发表的一篇论文介绍说,用SOLiD新一代测序技术识别了一条小细胞肺癌
细胞株中的
基因突变,同时还确认了该变异与吸食烟草之间的关系。该研究证明了新一代测序技术可以为对癌症中基因变异过程、细胞修复路径以及基因网络的研究提供崭新而富有意义的视角。
美国摇滚巨星黑暗王子的基因测序经历
Ozzy Osbourne是众所周知的美国摇滚巨星黑暗王子。他的生活的混乱程度和他的歌艺一样惊人,多次严重酗酒,也曾吸食过毒品。然而,他的健康状况目前为止却没有出现大的问题。Life Technologies公司提供了SOLiD4测序设备对Osbourne的基因组进行了测序,测序所得的信息被复制到了USB磁盘中,经过数据分析,Osbourne基因中隐藏的秘密最终公之于众。测序结果表明:他的ADH4基因的一个重要部分发生了很少见的变异情况,这种变异可以代谢掉身体中的酒精。点此详见
人类基因组计划
人类基因组计划 是1986年由美国科学家、诺贝尔奖获得者达尔贝科提出的,其目标是测定人类23对染色体的遗传图谱、物理图谱和DNA序列,换句话说测出人体细胞中23对染色体上全部30亿个碱基(或称
核苷酸)的序列,把总数约10万个的基因都明确定位在染色体上,破译人类全部遗传信息。点此详见
生物信息学的意义
生物信息学(bioinformatics)是80年代未随着人类基因组计划(Human genomeproject)的启动而兴起的一门新的交叉学科。 1995年,在美国人类基因组计划(HGP)第一个五年总结报告中给出了一个较为完整的生物信息学的定义:生物信息学是包含生物信息的获取、处理、贮存、分发、分析和解释的所有方面的一门学科,它综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具进行研究,目的在于了解大量的生物学意义。
生物信息学一大重要的任务是如何运用数理理论成果对生物体进行完整系统的数理模型描述,使得人类能够从一个更加明确的角度和一个更加易于操作的途径来认识和控制自身以及所有其他的生命体。从科学的角度来讲,它是一门研究生物和生物相关系统中信息内容物和信息流向的综合系统科学,只有通过生物信息学的计算处理,我们才能从众多分散的生物学观测数据中获得对生命运行机制的详细和系统的理解。从工具的角度来讲,它是今后几乎进行所有生物(医药)研究开发所必需的舵手和动力机,只有基于生物信息学通过对大量已有数据资料的分析处理所提供的理论指导和分析,我们才能选择正确的研发方向,同样,只有选择正确的生物信息学分析方法和手段,我们才能正确处理和评价新的观测数据并得到准确的结论。